他召来徐光启、王在晋、海文渊、新任礼部尚书钱士升（原南京礼部侍郎，因支持新政被破格提拔）。
“三线战报，诸卿都看了。当务之急有三：一平陕西民乱，二固江南新政，三定朝鲜向背。”
王在晋先开口：“皇上，陕西民乱虽只万余，但若处置不当，恐成燎原之势。臣建议双管齐下：一面调边军精锐镇压，一面减免陕西赋税，安抚百姓。更关键的是——”他顿了顿，“要查明民乱根源。若只是饥民求活，可招抚；若有人煽动，必严惩。”
朱由检点头：“准。传旨陈奇瑜：第一，乱民只诛首恶，胁从不同；第二，开仓放粮，赈济饥民；第三，彻查地方官员贪腐，凡有盘剥百姓者，立斩。”
他看向徐光启：“先生，科学院可有新式农具，能助陕西抗旱？”
徐光启早有准备：“回皇上，薄珏改良的‘深翻犁’已试制成功，可深耕一尺，保墒抗旱。另有‘筒车’设计，可利用河流落差提水灌溉，无需畜力。臣建议，调拨一批往陕西，助百姓恢复生产。”
“好。”朱由检道，“但记住，农具再好，也要有人教百姓使用。命新民学堂选派优秀生徒，随农具前往，实地指导。”
接着商议江南之事。海文渊禀报：钱家被查后，江南士绅震动。有十七家主动补缴历年欠税，合计二十八万两；更有人出资赞助官办学堂，以求“将功赎罪”。
“这是好事。”朱由检道，“但也不能一味宽纵。传旨李信：凡主动补税、赞助新政者，既往不咎；凡阳奉阴违、暗中破坏者，严惩不贷。另外，官营织造厂要扩大规模，但必须保障工人待遇。朕要让天下人知道，新政不是与民争利，而是为民谋利。”
最后是朝鲜问题。礼部尚书钱士升道：“皇上，朝鲜首鼠两端，实因国弱。臣以为，当恩威并施。一面遣使申饬，要求朝鲜国王严惩主和派；一面增加援助，助其编练新军。若朝鲜仍摇摆不定……”他压低声音，“或可考虑换一个更听话的国王。”
朱由检沉吟。换国王风险太大，但若不控制朝鲜，辽东将永无宁日。
“先派使臣去。”他决断，“带三样东西：第一，朕的敕书，申明大明保护藩属之责；第二，鸟铳三千杆，火炮五十门，助其自守；第三，一份名单——凡与建州暗中往来者，朝鲜需自行处置。”
他顿了顿：“告诉朝鲜国王：大明可保朝鲜社稷，但朝鲜必须忠心不二。若再首鼠两端，朕不介意‘帮’他清理门户。”
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