一不做二不休，谋求自立，由于其部众皆驻守旧都龙城（今辽宁朝阳），在邺城势力单薄，慕舆根便列举旧都龙城之优势，奏请皇帝还都。
慕容恪闻之，知其图穷匕见，随即联合慕容评等宗师诸王，诛杀慕舆根及其党羽。
慕舆根被杀，前燕朝内震动，原从各郡县招募之军士，恐生大乱，逃跑者甚多。慕容恪为稳定朝局，言谈举止如常，王府不加护卫，并命其弟慕容垂驻守南镇蠡台（今河南商丘)，安抚收留逃跑军士，终令前燕国内安定如常。经过慕容恪多年呕心沥血的经营，前燕国力远超关中前秦，江南东晋，慕容恪遂想完成皇兄慕容儁之遗志。
公元365年2月，慕容恪与慕容垂合兵攻打东晋之洛阳。次月城破，俘杀守将沈劲。
慕容恪便以洛阳为大本营，乘胜夺取前秦之崤山、渑池等地，前秦皇帝苻坚大惊，亲率大军抵抗，并且遣使求救东晋。
不久，慕容恪因军务繁忙，鞍马劳顿，积劳成疾，又闻东晋欲乘邺城空虚，意欲北伐，随即率军回撤。
公元366年底，慕容恪病重，深虑皇帝慕容暐手无实权，太后可足浑氏意欲干政，便时常向皇帝慕容暐上奏举荐其弟慕容垂代替自己辅佐朝政，但是可足浑太后却因慕容垂之妻，时常轻慢自己，而对慕容垂并无好感，遂怂恿皇帝驳回慕容恪所奏，皇帝慕容暐也知慕容垂带兵多年，声望甚高，恐其主政，皇位受到威胁，对慕容恪之奏请，置之不理。
公元367年初，皇帝慕容暐听闻慕容恪已病入膏肓，亲临其王府询问后事，慕容恪强撑病体，说道：“慕容垂文武双全，才能只在管仲、萧何之下，皇上如命其主政，天下可定。否则，苻坚，桓温之辈定然来攻。”
慕容恪言终而卒，不想，皇帝慕容暐愤然离去，但仍念其劳苦功高，给予厚葬褒奖。
若知慕容恪死后，前燕走向何处，皇帝慕容暐如何对待其弟慕容垂，请看下章。