但是，对东罗马帝国来说，西西里岛控扼着东西地中海之间的重要航道突尼斯海峡，西西里南部的几个港口远比巴勒莫和墨西拿之类的大城市更重要，叙拉古——马耳他——迦太基三座港口连成一线，形成一道海上铁闸，如果在这里布置一支随时巡弋的分舰队，就能将整个航道置于东罗马帝国的监护之下。
西西里以北的墨西拿海峡虽然也是东西地中海之间的海上通道，但墨西拿海峡水流湍急，漩涡密布，不适合帆船通航，如果有得选，绝大多数商船队还是会选择更加安全的突尼斯海峡。
所以，虽然西西里岛自身产出对东罗马帝国价值有限，但其特殊的地理位置带来了难以估量的战略价值，对东罗马帝国的“东地中海内海计划”具有重要意义。
对于以撒来说，想要占据西西里岛，军事不是问题，民心不是问题，最大的问题就是西西里天主教会的叙任权争议。
罗马教廷向来自诩为整个天主教世界的最高精神领袖，曾在历史上因为神职人员任免权与各个世俗君主爆发了多次冲突，有赢有输，曾经迫使神圣罗马皇帝亲来请罪，也曾被世俗君主们肆意凌辱。
截止到15世纪末，罗马教廷的权威已经大不如前，除了神圣罗马帝国之外，教宗们已经很难在其他地方压服世俗君主，不少世俗君主已经在实际上收回了主教任免权，通过一些小手段迫使当地主教向他们效忠，梵蒂冈教廷仅在名义上享有至高叙任权。
东罗马帝国以东正教为国教，虽然也接纳了包括天主教在内的不少基督教其他教派，但思想和文化上的分歧在短时间内难以消失，如果东罗马帝国没能与罗马教廷在西西里争议上达成一致，西西里的未来很可能会因此蒙上一层阴影。
诚然，现在的罗马教宗西斯都四世与东罗马帝国关系尚可，罗维雷家族也还欠着以撒一大笔钱，他们大概不会在西西里岛上多做纠缠，但也一定不会将西西里主教叙任权彻底交给以撒，这对声望的打击实在太大了。
东罗马帝国向来是皇权高于教权，以撒当然可以罔顾西方教会的意见，直接将西西里的主教任免权收归自己之手，但这样一来，当罗维雷家族下野之后，后续的教宗很可能会在西西里岛借机生事，挑拨离间，甚至支持其他公教君主重夺西西里王位，带来持续的混乱与不安。
实际上，以撒还是准备参考过去的教会合一先例，玩弄“和稀泥”之法，西西里的各级教士由本地教会自主选举产生，并向皇帝效忠，接受皇帝任命，他们在赢得选举并获得皇帝
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