座小港，狮城新加坡，将其作为进攻马六甲城的前哨基地。
马六甲人虽然凭借还算强盛的国力挡住了最初的进攻，但他们长期以来的伊斯兰狂热主义倾向早就引起了不少人的怨念，强势君主一死，内忧外患之下，不少商人产生了别样的心思，试图在这次冲突中攫取更多利益。
3月1日，阿尔布克尔克在狮城新加坡颁布了《马六甲宣言》，指出戴着白头巾的穆斯林是马六甲城的灾祸，马六甲城内的所有穆斯林必须清除，但除了他们之外，印度教徒和佛教徒都能保证自己的所有利益不受侵犯，愿意向穆斯林统治者发动叛乱并支持基督徒统治的族裔，将得到完全自治权，获取比穆斯林统治时期更加优厚的对待。
这份宣言很快便通过阿尔布克尔克事先埋藏在马六甲城内的暗线传播给各个族裔的领头人，穆斯林统治者自然也得到了一份，猜忌和怀疑迅速滋生。
一时之间，族裔纷争和宗教矛盾愈演愈烈，不少穆斯林平民将自己心中的恐慌和愤怒发泄在非穆斯林群体上，混乱蔓延，治安失调，社会动荡。
接着，针对非穆斯林的迫害从底层传入上层，尽管宰相霹雳·墩一再劝阻，穆斯林贵族和穆斯林学者们还是执意要求政府将非穆斯林群体的商船和商人通通扣押下来，以免他们为阿尔布克尔克提供支援。
3月10日，一位印度裔商人和一位华裔商人找到了阿尔布克尔克埋藏在城中并伪装成阿拉伯人的密探，代表两个商人群体，将马六甲的城防图和布防图通通交给了他，还顺带标注了马六甲大桥的几处弱点。
七天之后，阿尔布克尔克再度全军集结，悍然进攻马六甲城，命所有火炮集中轰击横跨在马六甲河上的马六甲大桥，专门针对近几年才施工重修的几个桥段进行轰击。
将近一整天的轰击后，马六甲大桥轰然倒塌，东印度舰队开入内河，印度裔商船和华裔商船立马倒戈一击，非穆斯林群体也在长时间的重压下选择反叛，马六甲苏丹国岌岌可危。
由于东南亚国家落后时代的军事科技和军事素质，当海洋天险和大桥天堑不复存在后，他们几乎成为了待宰的羔羊，东方流行的火门枪根本不是火绳枪的对手，被马六甲人寄予厚望的象兵部队也因为移动迟缓，体格庞大，在巷战中沦为了舰炮与火枪的活靶子，受到惊吓的大象四处冲撞，反而让占据人数优势的马六甲军队难以摆开，被东罗马水手和非穆斯林反叛军分割击败。
3月18日晚，马六甲围城战宣告结束，马六甲王室在不同势
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